近日，生物所在Frontiers in Plant Science期刊（影響因子(zǐ)5.753/Q1）發表了題為(wèi)“The Construction and Exploration of a Comprehensive MicroRNA Centered Regulatory Network in Foxtail Millet (Setaria italica L.)”的(de)文章(zhāng)。

在植物生長(cháng)發育和(hé)響應環境應答過程中，MicroRNA（miRNA）及其靶基因發揮重要作用。目前，通過遺傳學(xué)等方法對植物中單個miRNA的(de)功能解析越來越多，但是谷子(zǐ)miRNA在基因調控網絡中的(de)作用特點以及與轉錄因子(zǐ)的(de)調控關系仍然未見報道(dào)。

該研究針對谷子(zǐ)拔節前期和(hé)灌漿前期這2個谷子(zǐ)生長(cháng)發育關鍵時期，開展谷子(zǐ)miRNA深度測序、降解組和(hé)轉錄組等多組學(xué)聯合分析，構建了以前饋環路（Feed-Forward Loop）為(wèi)基準單元的(de)谷子(zǐ)miRNA為(wèi)中心的(de)調控網絡，其中包括36個轉錄因子(zǐ)家族、266個核心轉錄因子(zǐ)、136個miRNA和(hé)2417個下遊靶基因以及他們之間的(de)調控關系。

下一(yī)步，利用該研究篩選獲得的(de)禾本科特有和(hé)谷子(zǐ)特有的(de)核心miRNA，綜合前期谷子(zǐ)重測序相關數據、谷子(zǐ)種質資源表型數據，挖掘和(hé)解析谷子(zǐ)千粒重等優異品質性狀的(de)關鍵基因及其調控途徑。

生物所職工鄧楊和(hé)客座研究生張浩林為(wèi)本文共同第一(yī)作者，我院張傑偉副研究員、魏建華研究員和(hé)楊效曾研究員為(wèi)共同通訊作者，論文的(de)第一(yī)通訊單位為(wèi)北京市農林科學(xué)院。該研究得到國家重點研發計劃、我院創新能力建設項目和(hé)國家重點實驗室開放基金的(de)資助。

谷子(zǐ)miRNA為(wèi)中心的(de)調控網絡