研究室介紹
圍繞組學(xué)共性技術的(de)開發與應用，開展基于高(gāo)通量測序的(de)新方法和(hé)新技術、單細胞組技術和(hé)組學(xué)大數據系統挖掘與分析研究，建設高(gāo)通量測序平台和(hé)組學(xué)大數據共享平台。
主要研究內(nèi)容包括基于噬菌體展示、酵母展示和(hé)mRNA展示的(de)全合成人源化納米抗體庫、天然納米抗體庫和(hé)免疫納米抗體庫，建立納米抗體的(de)高(gāo)效親和(hé)力定向進化、高(gāo)通量篩選制備平台；利用合成生物學(xué)等技術，對微生物基因表達調控元件進行挖掘和(hé)代謝工程改造，構建高(gāo)效細胞工廠，異源合成多種高(gāo)附加值的(de)天然産物。
主持國家自(zì)然科學(xué)基金國際(地(dì)區)合作與交流項目子(zǐ)任務1項和(hé)國家重點研發計劃子(zǐ)課題1項，主持院級項目9項。課題組自(zì)2017年(nián)成立至今第一(yī)作者或通訊作者發表SCI論文8篇。
人員構成
劉貴明，研究員；王國良，助理(lǐ)研究員；張黎黎，助理(lǐ)研究員；孫婧，副研究員，青年(nián)英才；蔡淼，助理(lǐ)研究員；張雲俠，助理(lǐ)研究員；博士後：周凱，張琳。
成果展示
| [1] | 基于高(gāo)通量測序平台的(de)組學(xué)共性技術的(de)開發與應用：實驗技術、基因組組裝策略方法、軟件開發和(hé)作物基因組數據庫構建。 |
| [2] | 基于高(gāo)通量測序的(de)農作物/微生物的(de)基因功能和(hé)表觀調控研究：我們團隊搭建了高(gāo)性能計算平台和(hé)高(gāo)通量測序平台，建立了作物基因組De novo組裝、重測序、轉錄組、甲基化、lncRNA 和(hé)miRNA建庫平台，開發高(gāo)雜合和(hé)多倍體作物基因組的(de)組裝策略和(hé)方法，開展基于高(gāo)通量測序的(de)基因功能和(hé)表觀調控研究，建立ATAC-seq、DAP-seq、RNA m6A修飾和(hé)ChIP-seq等技術。 |
| [3] | 基于單細胞和(hé)mRNA display、酵母展示技術，高(gāo)通量篩選和(hé)制備納米抗體庫。 |
| [4] | 基于微流控和(hé)CRISPR高(gāo)通量快檢系統，建立CRISPR/Cas的(de)現場可(kě)視(shì)化病原物檢測技術體系，建立設計物種特異性crRNA和(hé)RPA引物的(de)生物信息分析流程，進行CRISPR酶篩選和(hé)定向進化。 |
| [5] | 基于課題組高(gāo)通量測序技術、基因組設計、合成能力和(hé)CRISPR-Cas系統為(wèi)基礎的(de)基因組編輯技術的(de)研究，對微生物基因表達調控元件進行挖掘和(hé)優化，同時對微生物進行代謝工程改造，構建高(gāo)效細胞工廠，異源合成高(gāo)附加值的(de)天然産物。 |
